Експозиция „Археология” проследява времето от праисторията до епохата на Средновековието. Праисторията е представена от каменни и кремъчни оръдия на труда, тежести за стан (доказателство за появата на тъкачеството), култови фигури и керамика. От късното желязо са експонирани въоръжение, керамични съдове и различни култови предмети.

Най-голяма част от експозицията заемат находките, открити в Жаба могила –  каменни релефи, останки от колесница – четириколка, акротерий с лика на горгона Медуза.